Description du poste
Les missions du poste
Au coeur de l'Oncopole de Toulouse, le CRCT, avec tous ses partenaires (institutionnels, universitaires, cliniques, industriels, caritatifs...), stimule l'innovation en termes de recherche et d'enseignement dans la lutte contre le cancer.
Le CRCT conduit une approche intégrée entre la recherche, les soins et l'enseignement, dans une logique transversale et multidisciplinaire. Il accueille 18 équipes de recherche très performantes et huit installations centrales regroupées au sein d'un centre technologique.
Dans un cadre de recherche clinique sur la résistance aux thérapies, nous recherchons un(e) bioinformaticien(ne) pour assurer le traitement et l'analyse des données de séquençage ADN circulant et ARN.
MISSIONS PRINCIPALES :
- Traitement des données (Pipeline) : Mise en oeuvre et optimisation de pipelines de traitement (QC, alignement, quantification), appel de variants
- Analyse de l'expression différentielle : Identification des gènes différentiellement exprimés
- Identification de signatures moléculaires de l'adaptation ou la résistance tumorale
- Analyse fonctionnelle : Interprétation des signatures (Gene Ontology, GSEA, Pathways, etc.)
- Visualisation : Création de figures pour publication (Heatmaps, Volcano plots, PCA, etc.)
- Gestion de données : Organisation des fichiers et archivage des résultats
CDD de 9 mois, non renouvelable - temps plein - 38h30
REMUNERATION : À partir de 2421,65€ brut mensuel en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent.
Emploi-Type
A2A41 - Ingénieur-e biologiste en traitement de données
Pour en savoir +
· Sur l'Inserm: ; site RH:
· Sur la politique handicap de l'Inserm et sur la mise en place d'aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap:
Le profil recherché
APTITUDES :Rigueur méthodologiqueEsprit de synthèseCapacité à travailler en autonomieEXPERIENCES SOUHAITEES :Une expérience en analyse RNAseq sera appréciéeUne expérience sur environnement Linux/Unix (ligne de commande) sera appréciéeUne expérience avec un ordonnanceur (Slurm) sera appréciée
Bienvenue chez Service Public
Au coeur de l'Oncopole de Toulouse, le CRCT, avec tous ses partenaires (institutionnels, universitaires, cliniques, industriels, caritatifs...), stimule l'innovation en termes de recherche et d'enseignement dans la lutte contre le cancer.