Thèse Détection et Suivi Acoustique des Biofilms de Pseudomonas Traités par Bactériophages Application des Ondes de Coda Ultrasonores pour l'Évaluation de l'Efficacité des Traitements H/F

Détail du poste Établissement : Université Polytechnique Hauts de France École doctorale : Ecole Doctorale Polytechnique Hauts-de-France Laboratoire de recherche : Institut d'Electronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie Direction de la thèse : Dorothée CALLENS ORCID 000000016179851X Début de la thèse : Date limite de candidature : 2026-08-30T23:59:59 Les biofilms à Pseudomonas posent un défi majeur dans les industries agroalimentaires en raison de leur résistance aux agents de nettoyage classiques. L'utilisation de bactériophages pour les traiter constitue une approche prometteuse, mais nécessite des outils de suivi en temps réel pour évaluer leur efficacité. Cette thèse vise à développer une méthode innovante de surveillance des biofilms à Pseudomonas en utilisant les ondes de coda ultrasonores, s'appuyant sur les travaux de Bowei Chen (IEMN, 2019) sur l'acoustique appliquée à l'encrassement et la thèse de Maxime Decodts (Ceramaths,2024) sur les bactériophages. L'objectif est de caractériser la dynamique des biofilms traités par les phages, en corrélant les variations des signaux acoustiques et notamment par l'interférométrie des ondes de coda avec la structure, la viabilité et la réponse mécanique des biofilms. Cette approche permettrait d'optimiser l'efficacité des traitements bactériophagiques et de proposer une solution de suivi en temps réel adaptée aux environnements agro-industriels. Ce projet interdisciplinaire, alliant capteurs acoustiques, microbiologie et ingénierie des procédés, ouvrirait la voie à une nouvelle génération de méthodes non invasives pour le contrôle des biofilms en industrie agroalimentaire. Cette thèse s'inscrit dans la continuité d'une collaboration entre l'IEMN, sur le site de Valenciennes (UMR 8520) et l'INRAE - UMET PIHM (UMR 8207) , combinant expertise en acoustique et en microbiologie pour le suivi des biofilms bactériens. Elle intègre également le laboratoire Céramath de l'Université Polytechnique Hauts de France, reconnu pour son savoir-faire en phagothérapie. Développer une méthode innovante, non invasive et en temps réel de détection et de suivi des biofilms de Pseudomonas traités par bactériophages, en utilisant les ondes de coda ultrasonores. Identification de signatures acoustiques représentatives de l'efficacité du traitement phagique sur des biofilms : Culture de biofilms Traitement par bactériophages Mesures ultrasonores (ondes de coda) Corrélation acoustique-microbiologique. Le profil recherché Le candidat devra posséder de solides compétences théoriques en physique des ondes acoustiques (ultrasonores) dans les milieuxsolides. Il est également souhaitable que le candidat maîtrise des outils de modélisation numérique et possède des compétencesavérées en traitement du signal. De bonnes capacités d'expérimentateur et un intérêt marqué pour les applications biologie, santé,sciences de la vie seront également indispensables.